林峰教授团队研究为抗生素替代药的设计提出全新途径

于红博

福耀科技大学运载与智慧交通学院教授林峰为通讯作者的人工智能大模型团队论文“AMPGen: An Evolutionary Information-Reserved and Diffusion-Driven Generative Model for de novo Design of Antimicrobial Peptides”在 Nature 旗下期刊 Communications Biology （www.nature.com/commsbio， SCI Q1，中科院1区）发表。

作为全球对抗抗生素滥用的前沿科学研究，该团队瞄准具有关键生物功能但结构短小灵活的抗菌肽（Antimicrobial Peptides），创新研发了一个保留进化信息且基于扩散驱动的生成式大模型 AMPGen，可实现靶向特异性抗菌肽的从头设计。该系统为抗生素替代药的设计提供了一条全新的途径。他们提出的肽多序列比对条件输入显著提升了抗菌肽生成成功率，通过理化性质筛选和基于XGBoost算法的判别器评估，最终由基于LSTM的评分器完成靶向特异性评分，全自动输出了高质量候选抗菌肽。本研究验证的40条从头设计抗菌肽中，38条成功合成，其中81.58%表现出抗菌活性。这些由人工智能大模型AMPGen设计的抗菌肽在现有数据库中从未发现，且展现出强抗菌能力、序列多样性和广谱活性等优异特征。

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