图拓扑在生物医学知识图补全模型性能中的作用

于红博

摘要: 知识图谱补全越来越被广泛采用作为在生物医学研究中解决多项任务的有用方法，比如药物再利用或药物靶标识别。为此，多年来提出了各种数据集和知识图嵌入模型。然而，关于使数据集及相关建模选择对于特定任务有用的特性，人们知之甚少。此外，尽管知识图嵌入模型的理论性质已经被充分理解，但它们在这一领域的实际效用仍存在争议。在这项工作中，我们对公开可用的生物医学知识图的拓扑特性进行了全面调查，并建立了与实际任务中观察到的准确性之间的联系。通过发布所有模型预测和一套新的分析工具，我们邀请社区在我们的工作基础上继续努力，不断提高对这些关键应用的理解。

更新时间: 2025-09-18 08:09:02

领域: cs.LG,cs.AI,q-bio.QM

下载: http://arxiv.org/abs/2409.04103v2